Die Wissenschaftler extrahierten die in den Proben befindliche Erbsubstanz ( DNA ) und sequenzierten daraufhin einen stark variablen Bereich des bakteriellen ribosomalen RNA-Gens, den V6 – Bereich, in einem besonderen Verfahren, das einen sehr hohen Durchsatz erlaubt.
Nachdem sie die einzelnen Sequenzen zu mehr als 120.000 OTUs ( operational taxonomic units, d.h. zu taxonomischen Einheiten ) zusammengesetzt hatten, nutzten sie multivariate Datenanalysen, um herauszufinden, inwiefern die einzelnen Faktoren wie Umwelt, Geographie und Primärproduktion ( also die Produktion von Biomasse im Wasser ) die Veränderung der mikrobiellen Gemeinschaften beeinflussen.
www.mpi-bremen.deThe scientists extracted the total DNA from the samples and sequenced a highly variable region of the bacterial ribosomal RNA gene, the V6 region, by high-throughput sequencing.
After clustering the sequences into more than 120,000 OTUs ( operational taxonomic units ) they performed multivariate analyses to disentangle the respective contribution of environmental, spacial and primary productivity factors on microbial community changes.
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